控制和预防方法
预防感染需要在食品链的所有阶段采取控制措施，从农场的农业生产到加工、制造以及在商业机构和家庭环境中对食品的制作。现有的资料不足以为减少生畜发生肠出血性大肠杆菌感染提出有关农场采取具体干预措施的建议。然而，国家级开展的风险评估已指出，通过各种减少绞碎牛肉风险的策略（例如筛检屠宰前动物以减少将大量病菌带入屠宰场）可减少病例的数量。良好的卫生屠宰规范能够减少粪便对屠体的污染，但是不能保证制品不带有出血性大肠杆菌。向屠宰厂工人和参与生肉生产的人进行食品处理卫生教育对于将微生物污染降低到最低水平至关重要。同样，预防牧场原料奶的污染实际上并不可能，但是应对牧场工人进行良好卫生规范原则方面的教育，以便将污染降低到最低水平。消灭食品中的出血性大肠杆菌的唯一有效方法是进行杀菌处理，例如加热（如烹煮或加热杀菌）或照射。一些国家实施一项政策，即如果发现生绞碎牛肉含有O157:H7大肠杆菌，则将被视为已被污染。
对O157:H7大肠杆菌感染的预防措施同于为其它食源性疾病建议的措施（见下述基本食品卫生规范）。然而，对于肠出血性大肠杆菌必须加强一些措施，特别是由于它对诸如儿童和老年人等弱势群体的重要性。由于很多肠出血性大肠杆菌感染因接触游憩用水所致，对于避免这类水域和饮用水源遭动物粪便污染也很重要。
减轻公共卫生风险的建议
为确保直接或间接接触食物的人不会使食物遭受出血性大肠杆菌的污染，食品操作人员应遵循“推荐性国际法典标准，食品卫生通则”（CAC/RCP 1-1969，Rev.3/1997，Amd. (1999)；第VII部分 — 设施：个人卫生），刊载于：粮农组织/世界卫生组织食品标准联合规划，食品法典委员会。通用要求（食品卫生）。粮农组织/世界卫生组织，罗马，2001年（第二版）。
如世界卫生组织安全食品五大要素所述的良好食品卫生基本规范可预防很多食源性疾病病菌的传播，也能预防出血性大肠杆菌引起的食源性疾病。应在所有情况下实施这些建议，特别是“煮透”，至少使食物中心的温度达到70℃。
对芽苗菜生产者的具体建议
近年来，由于芽苗菜的营养价值，对其的食用越来越普及。然而，与这类生芽苗菜有关的食源性疾病暴发的报告增加了公共卫生机构和消费者对这一问题的关注。有关疾病暴发的调查指出，在芽苗菜上发现的病菌非常可能来源于种子。这些种子可能在田野中或收割、储存或运输中受到污染。在芽苗菜生长的过程中，存在于种子中的少量病菌能够迅速达到致病的数量。从而对此问题必须给予特殊关注。指导原则列于“新鲜水果和蔬菜法典卫生规范”有关芽苗菜生产的附件中（文件ACA/RCP 53-2003，可向食品法典委员会秘书处索取，电邮：codex@fao.org)。
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